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Questions fréquentes

Module : Résistances

Nouveautés CA-SFM version 2020

Les recommandations du CA-SFM ont évolué depuis 2019 avec désormais 3 catégories cliniques pour le rendu de l'antibiogramme : sensible (S), sensible à forte exposition à l'antibiotique (SFE) ou sensible à forte posologie (SFP) et résistant (R).

Le taux de résistance calculé par ConsoRes comprend les souches intermédiaires et résistantes.

En attendant la mise à jour de nos algorithmes de calcul, merci d'appliquer la procédure suivante si vous utilisez (et uniquement si) le référentiel 2020 ou 2021 :

  • Votre logiciel extrait les catégories S, SFE, R : ConsoRes comptabilisera seulement les R. Pour que le décompte des souches (dénominateur) soit juste, vous devez modifier tous les SFE en S (manipulation excel détaillée plus bas)
  • Votre logiciel extrait les catégories S, I, R : la catégorisation "I" correspond à SFE. Pour qu'elle ne soit pas associée aux souches résistantes, vous devez modifier tous les I en S (manipulation excel détaillée plus bas)

 

Manipulation Excel à effectuer :

  1. Ouvrir le fichier excel et sélectionner le contenu des colonnes à partir de la colonne H (ou 8) jusqu'à la dernière colonne contenant les résultats d'une molécule ATB. Ces colonnes doivent se griser. 

  1. Clic simultané sur les touches "Ctrl" et "F" du clavier.
  2. 'Rechercher' : écrire le symbole à remplacer (SFE ou I)
    'Remplacer par' : écrire le symbole à obtenir (S)

    Clic sur "Remplacer tout"

Enregistrer le fichier. Ce dernier est prêt à être intégré dans ConsoRes !

 

Le fichier contient plusieurs colonnes pour une même molécule

Lorsque votre fichier contient plusieurs colonnes pour une même molécule (avec présence ou non de résultats dans ces colonnes), un message d'incohérence apparait (cf. ci-dessous).

Le fichier d'extraction va alors devoir être retravaillé avant de pouvoir l'intégrer dans ConsoRes.

    

                               


Le fichier contient une unique colonne pour les phénotypes de résistance (entérobactéries)

Il va falloir créer 3 colonnes distinctes.

     


L'identification d'une céphalosporinase déréprimée n'est pas renseignée dans le fichier

Lors de l'import du fichier, une question vous sera posée afin de savoir si le laboratoire a précisé ou non l'identification d'un phénotype de résistance (BLSE, céphaloporinase déréprimée/haut niveau, carbapénémase). Il vous suffit de cliquer sur «non» pour le phénotype «céphalosporinase», vos résultats ne seront pas interprétés comme «absence d'identification de céphalosporinase» mais comme «absence de renseignement de l'information».


Le fichier ne contient que les BMR identifiées dans l'établissement

Le fichier est à revoir et doit contenir l'ensemble des prélèvements à visée diagnostique ayant fait l'objet d'un antibiogramme, quelque soit leur profil de sensibilité/résistance.


Les analyses sont effectuées par deux laboratoires différents

Il faudra alors importer deux fichiers différents par période, en identifant bien le laboratoire à chaque import. Les résultats seront ensuite additionnés pour les analyses. Lors de l'import des données du 4ème trimestre ou de l'année entière, le nombre de paires d'hémocultures réalisées et la version du référentiel du CA-SFM/EUCAST utilisé seront à renseigner par laboratoire.


Prélèvements réalisés au bloc

Tout prélèvement réalisé au bloc doit être rattaché à votre UF de bloc opératoire.

  1. Identifier les colonnes concernées grâce aux n° mentionnés dans le message d'erreur (ici n°30 "gm" et n°31 "gen")
     
  2. Filtrer les résultats
    Clic gauche sur les en-têtes de colonnes puis sur "filtrer et trier" et enfin "filtrer"

     
  3. Sélectionner les résultats d'une seule colonne et valider
    Clic sur la flèche d'une colonne concernée (au niveau des en-têtes de colonnes) et décocher la case "vides"

     
  4. Placer les résultats d'une colonne au sein de l'autre colonne (ici, résultats de la colonne 31 répercutés sur la colonne 30)
    Sélection des résultats puis clic sur le coin inférieur de la case (matérialisé par le symbole "+"). Clic gauche maintenu, glisser les résultats vers l'autre colonne

     
  5. Supprimer la colonne dont les résultats viennent d'être déplacés au niveau de la seconde colonne
    Clic droit sur le n° de colonne (ici 31) puis sur "supprimer"

     
  6. Enregistrer le fichier 
  7. Sélectionner 3 colonnes à droite de celle des phénotypes
    Clic droit : «insertion»
    Nommer les 3 colonnes «BLSE», «céphalosporinase déréprimée» et "carbapénémase»

     
  8. Sélectionner un seul phénotype (ex : BLSE)
     
  9. Placer la lettre «O» dans la 1ère cellule
    Double cliquer sur le coin inférieur droit de la case (matérialisé par le symbole "+")
    Toutes vos lignes sont ainsi complétées

     
  10. Recommencer la procédure pour les deux autres phénotypes